Należy zauważyć, że art. 15 ust. 1 ustawy o VAT zalicza do podatników tego podatku obok osób prawnych i fizycznych wykonujących samodzielnie działalność gospodarczą – także jednostki organizacyjne niemające osobowości prawnej. Nie oznacza to, że wspólnicy spółki cywilnej są zwolnieni z odpowiedzialności za jej zobowiązania z tytułu VAT. Fiskus może, bowiem domagać się od nich zapłaty podatku nieziszczonego przez spółkę cywilną.
Z taką ewentualnością muszą się liczyć zarówno obecni jak i byli wspólnicy. Ci pierwsi odpowiadają za zaległości podatkowe z tytułu zobowiązań, których termin płatności upłynął w czasie, gdy byli wspólnikami. Muszą również pokryć równowartość kwoty zwrotu VAT, która w tym okresie została nienależnie zwrócona spółce cywilnej albo była zaliczona na poczet innych zobowiązań podatkowych. Decyzji o odpowiedzialności podatkowej wspólników nie można wydać, jeżeli od końca roku kalendarzowego, w którym powstała zaległość podatkowa upłynęło 5 lat.