Odliczeniu podlega jedynie podatek naliczony przy nabyciu towarów i usług w takim zakresie, w jakim nabycie to jest związane ze sprzedażą opodatkowaną. Powstaje, więc pytanie o rodzaj tego powiązania. W odniesieniu do jego zakresu doktryna jednolicie przyjmuje, że prawo do odliczenie przysługuje także w przypadku, gdy związek pomiędzy zakupami a sprzedażą opodatkowaną ma charakter pośredni.
Stanowisko to potwierdził WSA w Warszawie w wyroku z 25 czerwca 2010 r. (III SA/Wa 499/10). Sąd uznał w nim, że określone w art. 86 ust. 1 ustawy o VAT uprawnienie do odliczenia podatku naliczonego należy wiązać z towarami i usługami kupowanymi w celu wykonywania czynności podlegających opodatkowaniu. Zatem chodzi tutaj o zakupy towarów, które przez podatnika w stanie przetworzonym lub nieprzetworzonym są odsprzedawane. Dotyczy to również towarów i usług, które służą wykonywaniu działalności, jednakże nie wchodzą bezpośrednio do substancji wytwarzanych przez podatnika np. różne wydatki kosztowe o charakterze ogólnym – najem pomieszczeń biurowych, obsługa prawna, usługi biurowe, porządkowe itp.