W sytuacji, gdy przy szkole (zarejestrowanym podatniku VAT) działa inny podmiot, np. stacja kontroli pojazdów, zachodzi konieczność oddzielnego obliczania należnego podatku VAT. Dzieje się tak w sytuacji, gdy stacja kontroli świadczy usługi okresowych przeglądów pojazdów. Usługi te opodatkowane są stawką 23% VAT.
Często podmioty działające przy jednostkach edukacyjnych posiadają działające podliczniki energii elektrycznej. Ale mimo to, dostawca prądu wystawia fakturę zbiorczą na energię właśnie na szkołę. Powstaje problem, w jaki sposób zaksięgować związane z prowadzonymi usługami operacje.
Prawo do odliczenia podatku naliczonego przysługuje w zakresie, w jakim towary i usługi są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych (art. 86 ust. 1 ustawy o podatku od towarów i usług).