Wśród nowości, dostosowujących ustawę o VAT do wyroków Trybunału unijnego, warto wskazać na definicje podatnika i próbek, czy wszelkich nieodpłatnych przekazań czy na nową definicję terenów budowlanych, która jest odpowiedzią na orzecznictwo sądów krajowych. Z kolei niezgodności z dyrektywą UE zostały usunięte przez modyfikacje m.in. w zakresie dostawy towarów używanych, ograniczeń w zakresie prawa do odliczenia podatku naliczonego, przemieszczenia towarów między państwami członkowskimi, czy zwolnień z opodatkowania. Ustawodawca doprecyzował też kilka kwestii, które budziły wśród podatników wątpliwości interpretacyjne. Dotyczy to opodatkowywania zaliczek w eksporcie, czy dokumentacji wymaganej dla stosowania 0% stawki VAT.
Do najważniejszych zmian, które wejdą w życie 1 kwietnia 2013 r. należą:
- wprowadzenie definicji terenów budowlanych, usuwającej rozbieżności między organami podatkowymi a sądami administracyjnymi w kwestii elementów decydujących o budowlanym charakterze danego terenu w przypadku, gdy nie został wydany dla tego terenu plan zagospodarowania przestrzennego oraz stosowna decyzja – ułatwi podatnikom stosowanie przepisów w zakresie zwolnienia z VAT;
- likwidacja, dla celów opodatkowania wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów, warunku wywozu z Polski w terminie 90 dni towarów, które mają być przedmiotem czynności odpowiadającej eksportowi lub wewnątrzwspólnotowej dostawie towarów na terytorium innego niż Polska państwa członkowskiego zmniejszy obowiązki ewidencyjne i informacyjne podatników;
- uproszczenie definicji działalności gospodarczej, przez jednoznaczne wskazanie, że nie obejmuje ona czynności okazjonalnych związanych z działalnością gospodarczą;