Jeżeli podatnik nie zdecyduje się na prowadzenie ksiąg, dochód z działów specjalnych produkcji rolnej ustala się przy zastosowaniu norm szacunkowych dochodu z określonej powierzchni upraw lub jednostki produkcji zwierzęcej.
Niezależnie od wybranego sposobu ustalania dochodu podatnicy, którzy osiągają dochody z działów specjalnych produkcji rolnej, są obowiązani składać w terminie do 30 listopada roku poprzedzającego rok podatkowy urzędowi skarbowemu deklaracje według ustalonego wzoru o rodzajach i rozmiarach zamierzonej produkcji w roku następnym - PIT-6.
Termin do 30 listopada dotyczy tylko tych podatników, którzy już osiągają dochody z działów specjalnych produkcji rolnej i zamierzają prowadzić produkcję w roku następnym. Natomiast przedsiębiorca rozpoczynający prowadzenie w ciągu roku działów specjalnych produkcji rolnej obowiązany jest zawiadomić o tym właściwego naczelnika urzędu skarbowego. Ma na to siedem dni od rozpoczęcia takiej działalności. Powinien w związku z tym złożyć deklarację PIT-6 o rodzajach i rozmiarach zamierzonej produkcji w danym roku.
Jeśli zdecyduje się na ustalanie dochodu na podstawie prowadzonych ksiąg rachunkowych, składa oświadczenie, deklarując wysokość przewidywanego dochodu (oświadczenie to jest elementem deklaracji PIT-6). Na podstawie PIT-6 organ podatkowy ustala wysokość miesięcznych zaliczek na podatek dochodowy od osób fizycznych z tytułu prowadzenia działów specjalnych produkcji rolnej.