W przypadku zawarcia z własnym pracownikiem umowy zlecenia na dodatkowe czynności, wykraczające poza obowiązki wynikające z etatu, do przychodów ze zlecenia nie należy stosować opodatkowania ryczałtowego. Wykluczona jest bowiem możliwość stosowania ryczałtu w odniesieniu do przychodów z umowy zlecenia zawartej między pracownikiem a pracodawcą.
Zatem podatek od przychodów z dodatkowej umowy zlecenia zawartej z własnym pracownikiem należy obliczać na zasadach ogólnych, czyli według skali podatkowej, bez względu na kwotę wynagrodzenia ze zlecenia. W takich przypadkach podatek oblicza się od dochodu, a nie przychodu. Oznacza to jednocześnie możliwość odliczenia składek na ubezpieczenia społeczne oraz zdrowotne odpowiednio od dochodu i podatku.
Również organy podatkowe podkreślają, że zastosowanie zryczałtowanego rozliczenia ma zastosowanie do umów zawartych z osobami niebędącymi pracownikami. Stanowisko takie potwierdził Dyrektora Izby Skarbowej w Warszawie w piśmie z 5 listopada 2010 r., nr IPPB2/415-75/10-2/AS, w którym czytamy:
"(...) Mając na uwadze powołane wyżej przepisy, stwierdzić należy, iż uregulowania zawarte w art. 30 ust. 1 pkt 5a ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych będą mieć zastosowanie wyłącznie w sytuacji, gdy zostaną spełnione łącznie wszystkie przesłanki przewidziane tym przepisem. Zatem, zryczałtowany podatek dochodowy należy pobrać od tych przychodów określonych m.in. w art. 13 pkt 8 powołanej ustawy, co do których kwota należności jest określona już w umowie, miesięczna należność z tego tytułu nie może przekroczyć kwoty 200 zł i należności te muszą być uzyskiwane z tego tytułu jak również od tego samego płatnika.
Reasumując, w przypadku wypłaty wynagrodzenia, gdy z umowy zawartej z osobą niebędącą pracownikiem płatnika na wykonanie zlecenia - określonych czynności, wynika że przychód nie przekracza 200,00 zł miesięcznie, Spółka jako płatnik winna wynagrodzenie opodatkować zryczałtowanym podatkiem dochodowym w wysokości 18% przychodu.(...)".