Według art. 120 ust. 15 ustawy o VAT, jeżeli podatnik oprócz zasad VAT marża stosuje również ogólne zasady opodatkowania VAT, jest zobowiązany:
- prowadzić ewidencję sprzedaży z uwzględnieniem podziału w zależności od sposobu opodatkowania,
- w odniesieniu do dostawy opodatkowanej VAT marża ewidencja musi zawierać w szczególności kwoty nabycia towarów niezbędne do określenia kwoty marży.
Jak widać ustawodawca zobowiązał podatnika do prowadzenia szczegółowej ewidencji niezbędnej do prawidłowego określenia podstawy opodatkowania. Oznacza to w praktyce obowiązek prowadzenia dwóch ewidencji, przy czym ewidencja obrotu opodatkowanego na zasadach marży musi zawierać następujące dane:
- wartość nabycia towaru rozliczanego marżą,
- numer i dane dokumentu określającego cenę nabycia,
- wartość sprzedawanego towaru,
- datę sprzedaży,
- dane nabywcy,
- wartość marży brutto,
- wartość marży netto,
- kwotę VAT.