Nowelizacja ustawy o zasadach prowadzenia polityki rozwoju wdraża orzeczenia Trybunału Konstytucyjnego z 12 grudnia 2011 r. (SK 9/08) oraz z 30 października 2012 r. (SK 8/12), które zanegowały konstytucyjność niektórych przepisów ustawy z 6 grudnia 2006 r. o zasadach prowadzenia polityki rozwoju. Trybunał orzekł, że nie jest zgodne z Konstytucją RP regulowanie praw i obowiązków wnioskodawców w zakresie procedury odwoławczej na poziomie systemu realizacji programu operacyjnego, nie mającego charakteru aktu prawnego powszechnie obowiązującego.
W Ministerstwie Rozwoju Regionalnego zostały niezwłocznie podjęte prace nad przygotowaniem Komunikatu Ministra Rozwoju Regionalnego w sprawie listy programów operacyjnych na lata 2007-2013 i przysługujących w ich ramach środków odwoławczych oraz instytucji właściwych do ich rozpatrzenia. Załącznik określać będzie w sposób precyzyjny, jakie środki odwoławcze przysługują w ramach konkretnych programów operacyjnych, a także, jakie instytucje, realizujące programy, mają kompetencje do rozpatrywania tych środków.