W wyniku przeprowadzonej kontroli inspektor sanepidu może:
nakazać usunięcie uchybień - w razie stwierdzenia naruszenia wymagań higienicznych i zdrowotnych, w drodze decyzji, inspektor nakazuje usunięcie nieprawidłowości w ustalonym terminie;
nakazać zamknięcie szkoły - jeśli naruszenie wymagań spowodowało bezpośrednie zagrożenie życia lub zdrowia ludzi inspektor sanitarny nakazuje unieruchomienie szkoły lub jej części (stanowiska pracy, maszyny lub innego urządzenia); decyzje w tych sprawach podlegają natychmiastowemu wykonaniu;
powiadomić organ prowadzący - w razie stwierdzenia istotnych uchybień w działalności kontrolowanej jednostki mogących mieć wpływ na stan zdrowia lub życie ludzi, inspektor sanitarny zawiadamia o nich organ prowadzący szkołę. Organ prowadzący, do którego skierowano zawiadomienie, jest zobowiązany w terminie 30 dni od dnia jego otrzymania, powiadomić właściwego Państwowego Inspektora Sanitarnego o podjętych i wykonanych czynnościach;
nałożyć grzywnę - w razie powtarzających się wykroczeń inspektor może nałożyć grzywnę w wysokości od 500 do 1 000 złotych. Mandat nałożony przez inspektora (zgodnie z ogólnym wzorem mandatu) jest wystawiany na konkretną osobę.