W zakresie kontroli sprawdzającej stan zatrudnienia, w związku ze sprawdzeniem prawidłowości wywiązywania się z obowiązków płatnika minister podkreślił, że kompetencje do przeprowadzania kontroli dotyczącej zatrudnienia bez konieczności zawiadomienia przedsiębiorcy ma już Państwowa Inspekcja Pracy. Kompetencje tych dwóch organów nie powinny się na siebie nakładać, ponieważ może wpływać to negatywnie na warunki prowadzonej działalności bez wyraźnego uzasadnienia.
Wskazane byłoby w tej sytuacji zastosowanie rozwiązania opartego na współpracy organów podatkowych i Państwowej Inspekcji Pracy, polegającej na sprawnej wymianie informacji. Odnośnie do kontroli dotyczącej sprawdzenia prowadzenia działalności przez podmioty zarejestrowane do celów VAT sprawdzenie, czy działalność podatnika jest faktycznie prowadzona, powinno być wykonywane w ramach czynności sprawdzających, a nie kontroli.
