Jeśli pracodawca działa, jako administrator ZFŚS i kupuje towary i usługi, które następnie przekazuje nieodpłatnie lub częściowo odpłatnie pracownikom (albo innym osobom upoważnionym do korzystania z funduszu), to czynności te nie podlegają opodatkowaniu VAT.
Minister finansów przypomniał jednak, że nie dotyczy to czynności podejmowanych przez pracodawcę w ramach jego aktywności, jako przedsiębiorcy (podatnika VAT). Chodzi tu np. o usługę transportową wykonaną w związku z organizacją wycieczki dla pracowników (finansowanej ze środków ZFŚS w całości lub części), w ramach prowadzonej przez niego działalności gospodarczej.